Como o filtro de placas ou biológico utiliza o próprio substrato de fundo como elemento filtrante, sua manutenção consiste na sifonagem de fundo, realizada com sifão simples de tubo e mangueira. O objetivo é retirar o excesso de matéria orgânica acumulada entre o substrato. Deve-se ter o cuidado de não introduzir o sifão muito próximo das plantas para não danificar suas raízes. A frequência desta sifonagem e consequente troca parcial de água depende das condições particulares de aquário, mas podemos citar o intervalo de duas semanas como recomendação geral. Cerca de 20 % da água do aquário deve ser trocada a cada sifonagem, respeitando-se os valores de temperatura e pH da água restante no aquário. É muito importante não se esquecer da aplicação de Labcon Protect a cada troca parcial de água..
